Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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