Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HS2ST1Q7LGA3 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms