Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 SMAD9-201ENST00000350148 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 DCAF4-213ENST00000555042 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ETFRF1Q6IPR1 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms