Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms