Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 OTUD6B-206ENST00000617869 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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KRTAP21-1Q3LI58 AC093583.1-201ENST00000462083 2383 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TIMMDC1-208ENST00000494664 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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KRTAP21-1Q3LI58 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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KRTAP21-1Q3LI58 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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KRTAP21-1Q3LI58 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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