Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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