Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF827Q17R98 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF827Q17R98 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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