Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC018868.2-201ENST00000559655 1259 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms