Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms