Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPM4P67936 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TPM4P67936 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TPM4P67936 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TPM4P67936 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPM4P67936 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPM4P67936 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPM4P67936 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPM4P67936 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPM4P67936 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPM4P67936 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPM4P67936 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPM4P67936 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPM4P67936 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPM4P67936 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPM4P67936 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPM4P67936 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPM4P67936 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TPM4P67936 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPM4P67936 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPM4P67936 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TPM4P67936 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPM4P67936 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPM4P67936 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPM4P67936 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPM4P67936 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPM4P67936 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPM4P67936 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPM4P67936 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPM4P67936 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPM4P67936 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPM4P67936 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TPM4P67936 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms