Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 NT5C3AP1-202ENST00000441170 1663 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PLEKHA6-202ENST00000414478 5091 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms