Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCLCP48506 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCLCP48506 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms