Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT1P21579 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT1P21579 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms