Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 OACYLP-201ENST00000417918 2208 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 PLK4-210ENST00000514379 3060 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 KCNH6-201ENST00000314672 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 LINC00303-201ENST00000367207 1891 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 LINC01447-201ENST00000429010 2761 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 CHCHD7-201ENST00000303759 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TNFSF18Q9UNG2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms