Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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