Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 CICP3-201ENST00000440782 2455 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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SPOCK3Q9BQ16 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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SPOCK3Q9BQ16 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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SPOCK3Q9BQ16 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 POU2F2-201ENST00000342301 3730 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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