Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms