Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC12Q8WUD4 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms