Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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