Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLC16A6-205ENST00000620436 2055 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MDH2-201ENST00000315758 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LY9-205ENST00000392203 2213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FOXD2-AS1-201ENST00000445551 2509 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC008543.5-201ENST00000589227 2515 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A1AP-206ENST00000618046 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HERC6-203ENST00000380265 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ARMC1-201ENST00000276569 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM214B-201ENST00000322813 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHG3-204ENST00000484731 3001 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR1-208ENST00000397108 2870 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ASB15-201ENST00000275699 2706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM124B-202ENST00000389874 2594 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 OAS1-208ENST00000551241 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DDX3P1-201ENST00000418231 1950 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 STOML3-202ENST00000423210 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GBA-204ENST00000428024 1817 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 POM121L1P-202ENST00000605258 1835 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NIF3L1-204ENST00000409357 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRF5P2-201ENST00000423199 1659 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PLAT-204ENST00000429710 1655 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ECHDC1-209ENST00000454591 1515 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DEDD-210ENST00000490843 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 EZR-203ENST00000392177 2933 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM198B-202ENST00000478241 2924 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL031714.1-201ENST00000567829 2926 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SRSF7-209ENST00000446327 2453 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 EME1-201ENST00000338165 2339 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GAL3ST4-203ENST00000413800 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FGF11-203ENST00000575082 2315 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 POLE3-202ENST00000374171 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM107A-204ENST00000464064 2159 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC068831.1-202ENST00000557804 2159 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2G6-201ENST00000332509 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.3 ms