Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TCOF1Q13428 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TCOF1Q13428 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TCOF1Q13428 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TCOF1Q13428 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TCOF1Q13428 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCOF1Q13428 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCOF1Q13428 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCOF1Q13428 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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TCOF1Q13428 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCOF1Q13428 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCOF1Q13428 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCOF1Q13428 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCOF1Q13428 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCOF1Q13428 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCOF1Q13428 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCOF1Q13428 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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