Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms