Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 TBC1D3P3-201ENST00000342824 1080 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 TSACC-203ENST00000368253 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 HNRNPA1P19-201ENST00000405292 370 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 AC011890.1-201ENST00000427955 303 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 MTND6P14-201ENST00000433044 522 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 CTSLP1-201ENST00000457530 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 AL357137.1-201ENST00000604645 203 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 GIMAP4-202ENST00000461940 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NESP48681 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 KIR2DP1-201ENST00000415311 1331 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 AC006262.1-201ENST00000593980 1316 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 TSPEAR-AS2-201ENST00000330490 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 CXorf40B-201ENST00000355203 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 TMEM176A-201ENST00000004103 1261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 AC003101.1-201ENST00000412403 459 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 AL390061.1-201ENST00000457804 293 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 MIR2110-201ENST00000459421 75 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 IGHV3-6-201ENST00000518407 347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 Metazoa_SRP.163-201ENST00000611926 277 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NESP48681 VRK3-202ENST00000377011 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NESP48681 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NESP48681 ACAA2-205ENST00000587994 1657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NESP48681 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 ALDH7A1-203ENST00000413020 1126 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 LINC00106-201ENST00000430235 370 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 AL355309.1-201ENST00000442158 78 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 LINC01287-203ENST00000454441 1007 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 AL160313.2-201ENST00000555875 493 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 AC087463.4-201ENST00000561964 448 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 SKAP1-AS1-201ENST00000582246 687 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 AP005203.1-202ENST00000584204 561 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 LINC00868-203ENST00000592919 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 AC010976.1-201ENST00000631170 734 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 AL160408.6-201ENST00000632063 1257 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 TRMT61B-201ENST00000306108 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 GPR141-201ENST00000334425 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 OBP2A-202ENST00000342114 607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 RNA5SP469-201ENST00000364165 109 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 IL32-204ENST00000396887 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 CMTM1-206ENST00000457188 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 ARL15-205ENST00000507646 578 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 CMTM1-215ENST00000531885 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 ADIPOR1P2-201ENST00000554199 820 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 AC015936.1-201ENST00000591013 1028 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 AL590556.2-201ENST00000637118 1162 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NESP48681 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NESP48681 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms