Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 KRT36-201ENST00000328119 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 KIR2DP1-201ENST00000415311 1331 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 GNLY-201ENST00000263863 846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 NTF3-201ENST00000331010 1028 ntAPPRIS P3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 GPR141-201ENST00000334425 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 KRTAP13-1-201ENST00000355459 749 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 TCEAL9-202ENST00000372661 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 KRTAP12-4-201ENST00000391618 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 IQCF6-201ENST00000398780 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 PPP3CB-AS1-201ENST00000422977 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 TXNDC9-205ENST00000434323 733 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AL162464.2-201ENST00000557761 526 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 FAM9A-201ENST00000381003 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 ANXA3-209ENST00000512884 1335 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRMP28827 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SLURP1-201ENST00000246515 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 IGKV6-21-201ENST00000390256 406 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 CFAP36-205ENST00000407816 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 ART2P-201ENST00000415521 822 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC091893.1-201ENST00000503772 399 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AL139022.1-202ENST00000553633 796 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 MPI-212ENST00000565576 1148 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC104982.2-201ENST00000584258 893 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 MIR6750-201ENST00000617817 75 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 PRSS2-206ENST00000633969 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 HFE-204ENST00000349999 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 MEG8-220ENST00000636052 1369 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 OR2A5-201ENST00000408906 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC106774.3-201ENST00000505444 169 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 MEF2C-AS1-205ENST00000509179 388 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 PTDSS1-206ENST00000522072 1112 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 FAM86B1-215ENST00000533513 725 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC127537.3-201ENST00000566532 749 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC009034.1-201ENST00000568125 669 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC024580.2-201ENST00000623363 231 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 RNF141-202ENST00000528665 1374 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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