Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 DNM3-206ENST00000520906 4454 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 IL17REL-202ENST00000389983 3668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 BTD-201ENST00000303498 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 NRAP-203ENST00000369358 5534 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 FOSB-206ENST00000586615 3774 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 INTS8-217ENST00000523731 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PCBP1-AS1-227ENST00000435880 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TEX13D-201ENST00000632372 4203 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 EPHB6-201ENST00000411471 3367 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 KLF11-206ENST00000540845 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ZNF300-203ENST00000418587 3226 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AL359075.2-201ENST00000354921 4998 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TADA2B-205ENST00000515646 3818 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TIGAR-204ENST00000635110 3633 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AL133216.2-201ENST00000622550 7213 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SIRPG-202ENST00000303415 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SIRPG-204ENST00000381580 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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RAB4AP20338 SPECC1L-204ENST00000437398 6674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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RAB4AP20338 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CCDC144B-208ENST00000618081 8688 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ANXA11-205ENST00000438331 6965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AMPD2-201ENST00000256578 3899 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 REL-201ENST00000295025 11255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CEP89-207ENST00000591863 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CDHR4-202ENST00000412678 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CICP3-201ENST00000440782 2455 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CACNA1E-205ENST00000367570 9724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 RYR1-201ENST00000355481 15377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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