Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM58BPP0C7Q3 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms