Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms