Protein–RNA interactions for Protein: Q709C8

VPS13C, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 3,753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VPS13CQ709C8 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 SMN1-202ENST00000380707 1536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 SMN2-203ENST00000380743 1536 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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VPS13CQ709C8 RN7SL483P-201ENST00000478417 285 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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VPS13CQ709C8 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 NOSIP-204ENST00000596358 1005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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VPS13CQ709C8 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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VPS13CQ709C8 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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VPS13CQ709C8 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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VPS13CQ709C8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 GEMIN8-203ENST00000398355 1119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 AL133517.1-201ENST00000413412 748 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VPS13CQ709C8 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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