Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

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Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PRAMEF18Q5VWM3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PRAMEF18Q5VWM3 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PRAMEF18Q5VWM3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PRAMEF18Q5VWM3 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PRAMEF18Q5VWM3 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PRAMEF18Q5VWM3 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PRAMEF18Q5VWM3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PRAMEF18Q5VWM3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PRAMEF18Q5VWM3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PRAMEF18Q5VWM3 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PRAMEF18Q5VWM3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PRAMEF18Q5VWM3 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF18Q5VWM3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms