Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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