Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CALD1Q05682 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms