Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LOXHD1-204ENST00000398705 1824 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms