Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CASP4P49662 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP4P49662 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP4P49662 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms