Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC103925.1-201ENST00000453155 771 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 AC007405.2-203ENST00000455988 547 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 PSME2-213ENST00000560410 755 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 ZG16B-204ENST00000572863 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 ZEB1-AS1-207ENST00000606286 476 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 AC012313.9-201ENST00000619318 633 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NESP48681 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 SUMF1-203ENST00000405420 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 AP001610.1-201ENST00000411427 1116 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 RPL10P12-201ENST00000427342 318 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 LAIR1-217ENST00000474878 814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 AC138781.1-201ENST00000501322 505 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 AL354993.2-201ENST00000558738 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 AC006236.1-201ENST00000576249 797 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 MIR7-3HG-204ENST00000588758 865 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 MIR6749-201ENST00000617008 69 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 uc_338.24-201ENST00000617802 182 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 AL590096.1-202ENST00000618162 580 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 GMNN-207ENST00000620958 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 AL669831.6-201ENST00000635557 837 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 NR1I2-207ENST00000640105 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NESP48681 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 MYL2-201ENST00000228841 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 SYNGR4-201ENST00000344846 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 AGAP13P-201ENST00000417888 363 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 FGL1-206ENST00000518650 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 CHORDC2P-201ENST00000557601 1090 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 TNNT3-216ENST00000641119 941 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 SCARB2-202ENST00000452464 1495 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 IL17RB-201ENST00000288167 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NESP48681 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 FAM45BP-201ENST00000408950 1074 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 TGIF2P1-201ENST00000435390 685 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 KRTAP9-10P-201ENST00000435672 207 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 HINT1-208ENST00000513012 583 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 DHRS1-202ENST00000396813 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 ZSCAN29-207ENST00000568898 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 RPL15-202ENST00000354811 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 KRTAP13-1-201ENST00000355459 749 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 AC098934.2-202ENST00000438944 1033 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 AL445933.2-201ENST00000440249 265 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 RN7SL833P-201ENST00000498758 284 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 FANCI-214ENST00000567996 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NESP48681 AP005121.2-201ENST00000583306 1101 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms