Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANGAP1P46060 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms