Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCAMP43121 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms