Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 TPM3P7-201ENST00000338274 732 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLD1P28340 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 OR8B8-201ENST00000328064 1033 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms