Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB2P26583 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms