Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYT1P21579 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms