Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C4BP0C0L5 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC018868.2-201ENST00000559655 1259 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms