Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO1Q9P1Z2 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO1Q9P1Z2 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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