Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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TRMT13Q9NUP7 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TRMT13Q9NUP7 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TRMT13Q9NUP7 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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