Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 FAS-204ENST00000355740 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SYTL2-206ENST00000389960 4299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 MTRF1L-203ENST00000367233 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TCF21-202ENST00000367882 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 STRA6-201ENST00000323940 2864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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