Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT74Q96LB3 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms