Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms