Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms