Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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