Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK1EP49674 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK1EP49674 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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