Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK8P49336 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms