Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCAMP43121 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms